Colorectal Cancer Screening に関する書籍をざっと読んだ。大腸がんのスクリーニングが焦点。分子生物学的な観点も含めて記述してあって知識の確認になった。 Colorectal Cancer Pathways Petr Protiva Risk Factors and Screening for Colorectal Cancer J…

相関 2変数とも連続データで，正規分布に従っているならばPearsonの相関係数を用いることができる。 少なくとも1変数が非連続データの時にはノンパラメトリック検定のSpearmanやKendallの相関係数を用いる。これらは、実データでなく、順位付け（大小関係）…

チートシート R Studioのウェブサイトにまとまっており、 www.rstudio.com 以下のように様々なチートシートがある。 Data Wrangling with dplyr and tidyr Cheat Sheet Data Visualization with ggplot2 Cheat Sheet これは便利だ。

Network Meta-Analysis (NMA) 従来のメタアナリシスの課題 従来のメタアナリシスでは、２つの治療についての比較しか得られない。例えばうつ病に対する薬剤には多くの種類があり、有効性・安全性・薬価は様々である。 そこで、利用可能なすべての薬剤につい…

ポリファーマシー(Polypharmacy)とは 単純に「4～6種類以上の薬を飲んでいる状態」をさすこともあるが、問題になるのは、不適切な多剤併用である。 これを受けて、Polypharmacyとは、往々にして「必要以上に薬を飲んでいて、薬による有害事象が起こっている…

可視セルのみをコピーする ・Windows → 「Alt＋;（セミコロン）」 ・Mac → 「shift ＋ command ＋ Z」 のショートカットキーで選択して貼り付ければOKです。 A列が表示されない場合 隠れたA列を表示するには、B列から左にドラッグして 2C と表示されてからマ…

ggplotを手軽に ggplotのコードが覚えられない、忘れる。 何故かエラーになる、そんなことはありませんか？ ggplotを手軽に行うための関数があります。 その名も、qplot(quickplot) qplot qplot. ggplot2 2.1.0 ここを参考に色々な事ができる。 plot関数に近…

The glmmADMB package このパッケージを用いて、以下でinstallする。 install.packages("R2admb") install.packages("glmmADMB", repos=c("http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/repos", getOption("repos")), type="source") これでzero inflationなどの…