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Yoshi Nishikawa's Blog

データと知識、その調和平均。

ggplot2で平均値の推移をプロットする

http://nfunao.web.fc2.com/files/sgplot_vs_ggplot2.pdf

http://nfunao.web.fc2.com/files/R-ggplot2.pdf

CRAN - Package doBy

このあたりが参考になる。

ちなみに、

package “gplot"には、plotmeansという便利関数がある。