Yoshi Nishikawa Blog

医学となにかのインタラクティブ

RStan

WindowsでRstanをインストールした話~ Compilation ERROR の解決

Windows PCでrstanを使うべく、進めてみた、がうまくいかない。 compilation error その解決の備忘録として記しておく。 stan公式 RStan Getting Started (Japanese) · stan-dev/rstan Wiki · GitHub スペック Windows 10 64 bit R version 3.6.1 (2019-07-0…

ベイズ統計を学ぶ

ネット上にも、いろいろと教材が有るので、備忘録として載せておく。 Stan超初心者入門 階層モデルの分散パラメータの事前分布について 階層ベイズとWAIC Stanコードの書き方 中級編 Prior distributions for variance parameters in hierarchical models. A…

StanとRでベイズ統計モデリング

StanとRでベイズ統計モデリング (Wonderful R) 読んでいる。これは名著である。前半部分は、ベイズ統計関わらず、役立つ内容。とくに6章、モデリングの視点から確率分布に迫る箇所は、なかなかまとまったものがないので一見の価値あり。 1章 統計モデリング…

ベイズ的<ポストp値時代>の統計学キーワード集

Keywords 「はじめての統計データ分析」 を読み解いています。 キーワードを列挙し、まとめていきます。 1章 2章 EAP (expected a posteriori) MED (posterior median) MAP (maximum a posteriori) 3章 4章 5章 6章

sourceでソースファイルを読み込み関数を呼び出す

ベイズ的~を読みこなすために、ソースファイル内の関数を呼び出す必要があった。そのために、source()について学んだので覚書をしておく。 macユーザーなので、まず、UTF-8に変更し、文字化けを防ぎ、 setwd("~/Rstan") #ワーキングディレクトリを設定 sourc…

文字コードをmac対応のUTF-8に変更する

ベイズ的~の実装を試みても、 構文解析中に不正なマルチバイト文字列がありました (1 行) と表示されて全然Rファイルが文字化けして読み込めないので、文字コードをmac対応のUTF-8に変換してみました。 terminalでnkfコマンドを使うと、簡単に出来ます。 $ b…

データ整理にまつわるエトセトラ

お盆のお供にRStan お盆ですね。京都では、有名な五山の送り火があります。 とは言っても、病院に休みはありません。むしろ私は"休日当番"として働いています。その傍ら、「はじめての統計データ分析 ベイズ的<ポストp値時代>の統計学」を読み解いています。…